就在难波田宪次违背朝定的命令而擅自对小田原城准备攻击时，河越城内的朝定也得知了这个消息。虽然朝定对难波田宪次违背自己的命令而感到气愤，但是他并没有派人去制止。因为此刻有比让难波田宪次率军返回更重要的事情发生了。
上杉宪政的亲信近臣菅野信方和上原兵库二人受了武田信玄的贿赂后便向上杉宪政进言，说朝定自从进入关东开始就开始残害关东武家，导致例如武藏七党、深谷上杉家、仓贺野家等在内的多家武家名门断绝家名而且就连上杉宪政的居城平井城也不是由他自己来管辖，还是由已经倒向朝定的城代大石纲元来管辖的等等。
上杉宪政本来就是一个没主见的人，再加上菅野信方和上原兵库二人一直陪伴着自己，说的话也都是为自己考虑。随即上杉宪政便带着菅野信方和上原兵库二人一齐去见谦信了。
菅野信方和上原兵库二人先前在上杉宪政没逃往越后之前就喜欢干一些残害忠良的事情，此刻也没有例外。不论是山内上杉家的家宰还是谱代家臣和国人领主，都被他们陷害过。他们二人一见到谦信便当着她的面开始说着朝定的几大罪状：“派兵杀害幕府任命的关东公方”、“将古河公方逼反”、“长期残害关东武家，导致扇谷上杉家在关东一家独大”、“强取别家大名领地充当朝廷御料所”、“不敬神佛”、“用献金窜至高位”、“妄自尊大”、“意图取代关东管领”、“长期征伐周边不愿臣服的大名”、“将最上、伊达两探题家断绝滴流”等。
“老夫好不容易能回到自己的居城，可是连一点权力都没有。就算是税收还是征召军势等事务全都由城代大石播磨守来管辖，就连就连老夫派人去外边请来的歌舞伎都进不了本丸。”上杉宪政若不是自己的娱乐活动都被限制，才不会来趟这趟浑水。
“”谦信本想反驳一下菅野信方和上原兵库两人的话，但是听完上杉宪政的这番话她便沉默了。当初自己和朝定两人举兵联合关东诸将拥护上杉宪政回上野平井城就是为了实现对上杉宪政的承诺，让他领有原先的本据平井城。可是当初时局不稳，加上周边国人领主和后北条氏虎视眈眈，谦信不得不让原上杉宪政的谱代家臣大石纲元去担任平井城的城代。
“你如今还被幕府任命的政所执事、北陆探题，加上原先的关东管领、越后守护、越中守护等役职。你之前自己还说过坐受官爵，非人臣义也的话，难道都忘了？”上杉宪政倒是想到了谦信之前的承诺和誓言，此刻一股脑的全说了出来。
“不敢忘”谦信这下倒是下不了台了。原本她只想做做样子出兵到边境让朝定有所收敛，派人议和就行了。谁知上杉宪政倒是主动上门来逼宫了。而且谦信如今才发现上杉宪政这身边的两名近臣不是善茬。
谦信自从那天召开了评定会后就想过，元老级的家臣们都反对自己出兵，而且朝定只是一直驳了自己的面子并没有做出什么出格的事情，也不是真心想与自己为敌。况且，南出羽的色部胜长、竹庆纲、筑地资丰、大川忠秀、山本寺景长、千坂景亲等人有难之时皆是朝定去派兵救援的，若不是他去救援，很有可能转封至最上郡和村山郡各地的家臣们早就报销了。
上杉宪政一是前任的关东管领，二是谦信的养父。他的面子谦信不得不给。而且菅野信方和上原兵库所说朝定的罪状基本属实。
特别是朝定曾经在足利义辉前脚下达了御下任命足利义氏为关东公方，后脚就令家臣穴泽俊光攻入相模镰仓，将幕府所任命的关东公方足利义氏杀害，并且还将镰仓鹤冈八幡宫毁坏和抄掠宝物。光是这两件事情就已经让足利义辉感到朝定有不臣之心。若不是近卫前嗣与朝定交好，那么“朝敌”的罪名可就要按在朝定的身上了。
六月十日，作为谦信与幕府之间的联络人神余亲纲在这一天来到了越后府中馆，带来了足利义辉所下达的御下。内容是令谦信负责对关东的攻略，讨伐朝定并且重建鹤冈八幡宫。并且足利义辉还对足利藤氏之前的反叛不予追究，还主动任命他为关东公方。
谦信看到这些后差点忍不住把御下给撕了。要是真的与朝定开战，那么之前反对出兵的家臣们很有可能会被朝定所调略，特别是扬北众诸将。到时候还没进入关东自己倒成了光杆司令了。
足利义辉之所以敢下达这样的御下，完全是受到了佐竹家、小田家、武田家、小田原伊势家、大崎家、葛西家、户泽家、桧山安东家等大名的鼓动。俗话说得好：“三人成虎”，有了这么多人的上书进言，足利义辉就算不想颁下御下都不行。毕竟为了维护将军家的权威和仲裁能力，足利义辉只能这样做。
而且当足利义辉得知朝定派兵北上先后攻灭最上家、伊达家这两家世袭探题家的大名后就已经很愤怒了。这两家数任家督年年派人上洛献金从不间断，这下自己的财路都断了。再加上之前朝定派家臣穴泽俊光率军攻入相模镰仓，将自己任命的关东公方足利义氏杀害。足利义辉将新仇旧怨加起来后就断定朝定有不臣之心，若不及早剪除，那么就很有可能是取代足利家。
足利义辉虽然判定了朝定为幕府之敌，但是朝廷方面就不这么认为了。正亲町天皇好不容易获得了关东三万石土地当御料所，皇家总算告别了卖字画度日的生活，他可不想一夜回到解放前。朝中的不少公卿如关白近卫前嗣、权大纳言劝修寺晴秀、参议山科言继朝廷财物担当等也与正亲町天皇的态度是一样的。朝廷方面直接驳回了足利义辉所提出的“将藤原朝定指认为朝敌”请求。
由于这档子事一出后，关白近卫前嗣终于能如愿以偿的前往关东一次，以示朝廷与朝定是站在同一条战线上的。这次，近卫前嗣还带上了正亲町天皇的纶旨，朝定的修理大夫一职擢升为左近卫大将兼任镇守府将军为从三位此时的足利义辉以征夷大将军兼任参议、左近卫中将才从三位，并且朝定能讨伐关东一切不臣之臣的权力。
六月十二日，就在小田原城内的内应春日家吉和宫木四郎兵卫二人率部袭杀二之丸守将石川源四郎后便迅速打开了侧门准备放上杉军入城。难波田宪次见二之丸的侧门打开后为了保险起见，并不打算一开始就投入太多的兵力去进入二之丸。他就立即令冈部元信和穴泽俊光二人率两千军势先行突入二之丸。
由于二之丸的守将石川源四郎被杀后，剩余的二之丸守军便群龙无首，毫无士气。很快，随着冈部元信和穴泽俊光两部的突入后，守军便四散而逃。冈部元信和穴泽俊光二人便乘势夺取了二之丸，派人通知难波田宪次，二之丸侧门的开启并不是陷阱。
得知不是陷阱的难波田宪次随即令朝比奈泰朝率两千军势从正面攻打小田原城的大手门来吸引守军的注意力，自己则是率一万大军迅速进入二之丸，让冈部元信和穴泽俊光二人扩大战果继续对小田原城内各地展开攻击。
很快，本丸里的伊势氏政也得知了二之丸的陷落、三之丸腹背受敌的情况。伊势氏政很想补救一下，但是此时已晚。随着大量的上杉军涌入城内，以老弱病残占很大比例的守军完全支撑不住。紧接着，还没等伊势氏政派出援军去救援三之丸，东之丸和西之丸两地就被朝比奈信置攻落了，守将山角右卫门和上野孙左卫门二人战死。
不到三个时辰，小田原城便只剩下本丸还在伊势氏政的手里。而其他地区全被上杉军所攻占。伊势氏政不愿投降上杉家，便与凤翔院伊势氏政正室、瑞溪院伊势氏政生母等家眷还有御马众的今井源太郎、今井雅乐助等在本丸大广间内自害。立足关东四代的后北条氏正式灭亡。
