正在此时原先在更始政权做官的刘嘉和来歙（君叔，刘秀的表兄）来到洛阳朝见建武帝。
赤眉军攻破长安后，刘盆子下令诸将寻找自己的哥哥刘恭，东找西找，最终在一间诏狱中找到了刘恭，更始政权虽然被赤眉军彻底打垮，但是还没有投降以及传国玉玺还未交出。
樊崇就以建世皇帝的名义下诏书：“只要圣公肯投降并且交出传国玉玺，封长沙王。”随后把这份诏书交给刘恭，让他前去说服刘玄。
刘恭在高陵一座废弃的宅院中找到了刘玄，便对他说“我代表建世皇帝向你宣读投降诏书，只要你交出传国玉玺，就封你为长沙王。”
过了二十天，刘玄这才答应刘恭接受投降，即可刘玄一行人等前往长安朝见建世皇帝，此刻刘盆子及赤眉军诸将在长乐宫升殿，刘玄见到刘盆子后，随即解下传国玉玺，就在这个时候从殿外来了两名将领押着刘玄。
刘恭惊愕的问：樊首领！您这是什么意思？
樊崇说：“既然传国玉玺已经交了，还留着他有什么用？”说完樊崇就吩咐两名将领将刘玄架出去处斩。
刘恭紧跟后方呼喊：臣该做的事情都做了，无能为力救圣公，立即拔出佩剑准备自刎，樊崇等人向前制止了刘恭的行为。
于是樊崇就把刘玄给放了，封他为畏威候，刘玄欣然接受，刘恭却不愿意了。
刘恭说：“您之前说过，圣公只要投降，封他为长沙王，你们不能言而无信啊！”
樊崇心想刘恭毕竟是现任皇帝的哥哥，又把刘玄改封为长沙王。
这时长安附近的几个郡县官吏听说皇宫之中又换新主人了，拿的贡品朝见建世皇帝，赤眉军诸将得知这个消息之后，埋伏在通往长安的必经之路，几名郡县官吏用马车拉着贡品正在行驶，突然赤眉军冲出将贡品全部一抢而空。
正值寒冬腊月，刘盆子及赤眉军诸将一同在宫中举行宴会，刘盆子上座，其余列卿分成两排入座，这时原先的更始将领知道举行国宴时的流程，于是就在竹简上面写上自己的名字呈给建世皇帝，赤眉军没有见过这个，一时一哄而上挣着抢着都要把自己的名字写在竹简上面，因为没有抢先写上自己的名字，而发生了私斗，场面混乱不堪。
这时大司农杨音实在看不下去了，随即拔出佩剑大声呵斥道：“你们这些人简直都是不懂礼法的老佣人，今日设君臣之礼都当成儿戏了，让你们这么一闹，反而更加混乱，你们就应该斩首。”
话音未落，殿门突然打开，冲出一些赤眉士兵，把桌上的酒肉你抢我夺，为了争抢这一顿盛宴，甚至互相杀伤，卫尉诸葛稚听到有吵闹声，带领兵士进入宴会殿内杀了几百人闹事者，总算平息了混乱局面。
事后刘恭见到赤眉军治军不严，恐难成大事，便去找到刘盆子，对他说：“赤眉军，虽然攻下了首都长安，但是他们军纪不行，跟着他们干恐怕没有任何前途，必要的时候你可以交出玉玺，向赤眉诸将提出辞去皇帝之位。”
建武二年（公元26年）立春之际
真定王刘扬因为不满建武帝不给自己加官进爵擅自制造谶语，以赤九之后，瘿扬为主蛊惑人心，建武帝大怒，派骑都尉陈副，游击将军邓隆北上讨伐刘扬，两人到达真定城下，只见城门紧闭根本进不去。
消息传到洛阳后建武帝为了削落刘扬的叛乱，再派耿纯持节赦免幽州，冀州，并交代耿纯说：”所过之处要慰问王侯。“另外还密令对耿纯说：如果刘扬召见你，将其拿下。
随后耿纯带领着百余骑兵到元氏县时与陈副，邓隆相遇，一同奔往真定，耿纯来到真定城下告诉站岗士兵，要求见真定王，刘扬给传话人说：”自己生病了，需要休息，谁也不见。“
耿纯听说刘扬病了嘿嘿一笑，这分明是不想见我而推辞的借口，便继续在城下等消息，刘扬思前想后见一见应该不会把我怎么样，况且耿纯的母亲还是出自我真定宗亲，于是写信派人抛下城。
耿纯打开信一看：我得去见一下王侯和那些牧守，因为我事先与他们约好了，你如果要见我的话，先到传舍等待一会，我马上就来，耿纯说道：”这老家伙总算答应见我了。”
刘扬去见完所谓的王侯牧守后心想其弟临邑王刘让以及从弟刘细拥兵万余人，且耿纯并没有作出攻城的举动，随即带领着官属去见耿纯，两人互相作揖，耿纯延请刘让，刘细，等到进入传舍后聊了几句话，耿纯迅速把房门关闭，把三人斩杀，真定郡震恐，无人敢轻举妄动。
耿纯饭后洛阳后告知了平叛消息，建武帝念及刘扬等人没有造成损失且刘扬虽然死了，但在真定实力依然还存在，便封刘扬的儿子为真定王。
长安皇宫
一天上朝的时候，赤眉诸将之间发生了不愉快，原因是争夺功劳，实在说不过别人就拔出佩剑砍击殿柱。
刘恭见此说了一番话：“诸位将军不要再争吵了，先听我说完一句话，你们拥立我弟弟做皇帝已经一年了，现在没有作出任何功绩，这说明我弟弟不适合当这个皇帝，你们还是另请贤能之人担此皇帝大任。”
一些将领不满意的说：陛下，还没有说什么，你在这瞎操什么心？
这时刘盆子想起哥哥前几天说的话，随即走下御座跪求赤眉诸将：“诸卿虽以正义之师自居，各郡县官员给朕的贡品，你们半道上就把贡品给截了，做出来的事情都是强盗那些行为，你们严重打扰了老百姓的生活，他们有怨恨却又不敢说。”随即刘盆子解下玉玺
樊崇等人跪下自责的说：这都是我等办事不力，还酿成此祸，请陛下放心，从今往后再也不会发生这样的事情了。
刘盆子这一招果然有了效果，赤眉军诸将安分了许多，不再到长安街道上掳掠财务，各郡县官员称赞道：“当今天子还没有到落冠之年就如此聪明，总算管住了赤眉诸将不发行为。”
逃亡在外的老百姓看到长安平静如常，于是纷纷就回到了原籍，长安的店铺又重新开张起来了，赤眉诸将本性又开始蠢蠢欲动，又展开新一轮的抢劫。
长安百姓都怨恨的说：“当年被新莽给害苦了，更始主政以来还不如新莽那段时间，自从赤眉军来到长安政局更加混乱，还不如更始政权。”
这句话不知什么风刮到大司农杨音的耳朵里，就去告诉了樊崇，樊崇担心夜长梦多，弄不好还要复辟更始的话，于是派谢禄杀刘玄于长安郊外。
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洛阳皇宫
葵丑日南宫的却非殿，文武朝臣并列两排，连呼三声：吾皇万岁万岁万万岁。
建武帝说：“众卿平身，赤眉贼军已得长安，但是纲纪败坏，纵容士兵抢夺老百姓的财物，朕决定赤眉贼军，把他们赶出长安城，让老百姓不再恐慌，朝中有哪位将将领愿意前去平叛。”
此时大司徒邓禹站出来手持笏板说：臣邓禹愿带兵前往平叛。
建武帝说：“朕就封你为梁候，食邑万户，即刻率兵前往长安。”
邓禹接过建武帝赐给自己的印绶后，带领将士们奔赴长安，很快到达了长安，邓禹却迟迟不进攻，一些将领催促攻打长安城。
邓禹说：“我的人马虽多，但是能打仗的悍将少，况且赤眉贼军刚刚攻下长安城不久，士气高涨，财富充实，他们都是盗贼出身，很难顾守城池，我听说上郡（今陕西省榆林市绥德县）及其他两个郡地广人稀，而且粮食还很充足，我们到那里操练兵士，以观其变，便可拿下长安城。”
赤眉军的侦察兵打听到了汉军就在附近，于是樊崇遣派部将诸营保前去抗击汉军，邓禹也得到了消息，两军在栒邑（今陕西省咸阳市旬邑县）展开激战，最终邓禹完胜为结束。
建武帝听说邓禹迟迟不攻打长安城，就拟了一份诏书，派人快马加鞭送到前线，邓禹得到诏书后打开一看，上面写道：“大司徒就是尧的军队，赤眉贼军就是夏桀，你应该马上攻打他们，长安城中的老百姓惶惶不可终日，他们不知道应该归附谁，快点安抚民心。”邓禹不敢违抗圣意，挥兵进攻上郡诸县，留下冯愔和宗歆镇守栒邑。
此时河西太守宗育将自己的儿子送给邓禹那边，表示愿意归降，正在邓禹顺利攻克州县的时候，内部出了问题，留在栒邑的冯愔为了争夺权利不惜杀害另一名镇守将领宗歆，欲要反叛邓禹。
邓禹得到这个消息后非常气愤，暂时停下进攻战事，连忙赶回去，见到冯愔愤怒的说：“我让你们两个人坚守岗位，竟然为了争权杀死自己人，大家都是兄弟，至于吗？”邓禹没有处于好这件事情，也许是因为年轻，这一年，他只要二十四岁，便派人去洛阳将此事告诉建武帝。
报信人见到建武帝说：大司徒手下的两名将军发生了矛盾，一名将军诛杀了另一名将军，大司徒派我来询问陛下，这件事情如何解决？
建武帝说：“那名反叛者最信任的人是谁？”
报信人说：是他的贴身护军黄防。
建武帝小笑说：“你回告诉邓禹，这件事情很好办，这个黄防必定会效仿那名反叛者。”
这名报信人回去之后说：陛下让我转告大司徒，这件事情请您放心，束缚冯愔的人必定是他的护军黄防。过了几天果不其然，黄防又杀死了冯愔。
二十天以后
长安城中没了生活来源，当时长安宫中的宫女要几千人，实在没有可吃的食物了，她们便扑捉池塘里的鱼吃，甚至还挖芦菔根吃，而且这些宫女互相商量好，谁先饿死谁就把自己掩埋，可见其生活无法依靠。
赤眉军眼看这样下去办法，于是樊崇便下令离开长安，去寻找有食物的地方，这时邓禹看到赤眉军渐渐远去，便下令全军进入长安城。
赤眉军因为饥饿，造成体力不支，没有走出长安境内，没有吃的这个如何是好啊！樊崇想出来了一个能换取钱财的物品，就是盗倔汉帝陵，把里面的金银财宝通通取之而光，并且还把吕雉的陵寝也给盗了。
盗完帝陵之后，又准备回到长安，赤眉军到了长安东都门，看到汉军已经占领原本属于自己的城池，心中的怒火一下子蹭起来了，随即一场大战，邓禹无奈撤出长安城。
调整好部队之后，邓禹派车骑将军邓弘迎击赤眉军，自己则在旁边观战，几个回合后赤眉军被邓弘打跑了，只留下了一辆装满豆子的淄重车，汉军这边正好没有粮食了，正在把淄重车带回时却发现这是赤眉军使用的障眼法，只是上面有一层豆子，下面全是土。
此时邓禹接到了建武帝的诏书，命令他撤军，邓禹心想再和赤眉军交战一次，诸将劝说：现在士兵们空腹应战，恐怕难以打胜。
邓禹没有诸将的建议，又和赤眉军展开激战，结果又战死了三千余人，两万精兵几乎全军覆没，只带领着二十四个人逃回洛阳。
邓禹见到建武帝非常惭愧的说：臣辜负了陛下的期望，请陛下将臣的大司徒印和梁候印收回，以示谢罪。
建武帝安慰的说：“胜败乃兵家常事，大司徒不要埋怨自己，朕就收回你的大司徒印，梁候印你还继续拿着。”建武帝这一举动避免别人说闲话
即刻派冯异继续讨伐赤眉军，有一次冯异弃马逃回阵营，冯异不得不采取智取的方法结束这场战争，他挑选精锐士兵便让他们换上赤眉军服，并且把眉毛染成红色，以此迷惑敌人。
这一天冯异又去攻打赤眉军，激战过后，赤眉军死伤过半，樊崇看形势不妙，便下令撤军，走到半路上突然有一支伏兵冲出来，樊崇一看是自己人并没有多想，后面冯异追过来了，列队迎战，瞬间两军混战，所谓的伏兵杀向眉毛标志的人，被打得溃不成军，追至崤底（今河南省洛阳市阳店镇）大破之，并俘获八万人，樊崇等将领及十万人丢盔弃甲往南逃，邓禹等人一路狂奔，追到了宜阳（今河南省洛阳市宜阳县）。
建武帝得知冯异打击了赤眉的锐气，写了一封表扬信：“大破赤眉都是公孙你以及将士们的功劳，公孙在日出之时虽然失败了，却在日落之时又重新取得了胜利，可谓失之东隅，收之桑榆。”（东隅是指早晨，桑榆是指黄昏，这就是此成语的由来）。
此时建武帝遣派两路大军，决定一举消灭赤眉军，一路由破奸将军候进等几名将军屯兵于新安（今河南省洛阳市新安县），另一路由建威大将军耿弇等几名将军屯兵于宜阳，并且告诉他们说：“赤眉贼军若是进攻东边，就把宜阳的兵调回新安，若是往南边进攻，就把新安的兵调回宜阳。”
这个时候赤眉军正在行走在宜阳境内的熊耳山，走着走着前方一支大军拦住了去路，赤眉军诸将感到惊恐，不知道该不该投降。
(本章完)
